Publications
2025
Journal papers
- titre
- The HCP multi-pipeline dataset: an opportunity to investigate analytical variability in fMRI data analysis
- auteur
- Elodie Germani, Elisa Fromont, Pierre Maurel, Camille Maumet
- article
- Accepted for publication in Scientific data, Data available on Public-nEUro.
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- titre
- On the validity of fMRI studies with subject-level data processed through different pipelines
- auteur
- Elodie Germani, Xavier Rolland, Pierre Maurel, Camille Maumet
- article
- Imaging Neuroscience 3. ⟨imag_a_00522⟩.
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-
- titre
- Predicting Parkinson's disease trajectory using clinical and functional MRI features: a reproduction and replication study
- auteur
- Elodie Germani, Nikhil Baghwat, Mathieu Dugré, Rémi Gau, Albert Montillo, Kevin Nguyen, Andrzej Sokolowski, Madeleine Sharp, Jean-Baptiste Poline, Tristan Glatard
- article
- PLOS ONE 20(2): e0317566. ⟨10.1371/journal.pone.0317566⟩.
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-
Conference papers
- titre
- Bias and Generalizability of Foundation Models for Breast Mammography Classification
- auteur
- Elodie Germani, Ilayda Selin Türk, Fatima Zeineddine, Charbel Mourad, Shadi Albarqouni
- article
- Accepted for publication at MICCAI 2025.
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- titre
- Mitigating analytical variability in fMRI results with style transfer
- auteur
- Elodie Germani, Camille Maumet, Elisa Fromont
- article
- Accepted for publication at MIDL 2025.
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2024
Conference papers
- titre
- Uncovering communities of pipelines in the task-fMRI analytical space
- auteur
- Elodie Germani, Elisa Fromont, Camille Maumet
- article
- 2024 IEEE International Conference on Image Processing (ICIP), Abu Dhabi, United Arab Emirates, 2024, pp. 3044-3050. ⟨10.1109/ICIP51287.2024.10647701⟩
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-
Workshop or conference summaries
- titre
- Proceedings of the OHBM Brainhack 2022
- auteur
- Stefano Moia, Hao-Ting Wang, Anibal S. Heinsfeld, Dorota Jarecka, Yu Fang Yang, Stephan Heunis, Michele Svanera, Benjamin De Leener, Andrea Gondová, Sin Kim, Arshitha Basavaraj, Johanna M. M. Bayer, Roza G. Bayrak, Pierre-Louis Bazin, Isil Poyraz Bilgin, Steffen Bollmann, Daniel Borek, Valentina Borghesani, Trang Cao, Gang Chen, Alejandro de La Vega, Sebastian Dresbach, Philipp Ehses, Jan Ernsting, Inês Esteves, Oscar Ferrante, Kelly G. Garner, Rémi Gau, Elodie Germani, Tara Ghafari, Satrajit S. Ghosh, Sarah E. Goodale, Cassandra D. Gould Van Praag, Samuel Guay, Omer Faruk Gulban, Yaroslav O. Halchenko, Michael Hanke, Peer Herholz, Katja Heuer, Felix Hoffstaedter, Ruoqi Huang, Renzo Huber, Ole Jensen, Kan Keeratimahat, Julian Q. Kosciessa, Sladjana Lukic, Neville Magielse, Christopher J. Markiewicz, Caroline G. Martin, Camille Maumet, Anna Menacher, Jeff Mentch, Christian Mönch, Shammi More, Leonardo Muller, Leonardo Muller-Rodriguez, Samuel A. Nastase, Eliana Nicolaisen-Sobesky, Dylan M. Nielson, Christopher R. Nolan, François Paugam, Pedro Pinheiro-Chagas, Ana Luísa Pinho, Alessandra Pizzuti, Benjamin Poldrack, Benedikt A. Poser, Roberta Rocca, Jacob Sanz-Robinson, Kelvin Sarink, Kevin R Sitek, Nadine Spychala, Rüdiger Stirnberg, Michał Szczepanik, Mohammad Torabi, Roberto Toro, Sebastian G. W. Urchs, Sofie L. Valk, Adina S Wagner, Laura K. Waite, Alexander Q. Waite, Lea Waller, Tyler J. Wishard, Jianxiao Wu, Yuchen Zhou, Janine D. Bijsterbosch
- article
- Aperture Neuro Vol. 4, 2024 ⟨10.52294/001c.92760⟩
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Poster communications
- titre
- Prédire l'évolution de la maladie de Parkinson à l'aide de données cliniques et d'IRM fonctionnelles: reproduction et robustesse d'une étude
- auteur
- Elodie Germani, Nikhil Baghwat, Mathieu Dugré, Rémi Gau, Andrzej Sokolowski, Elisa Fromont, Camille Maumet, Madeleine Sharp, Jean-Baptiste Poline, Tristan Glatard
- article
- IABM 2024 - 2ème édition du Colloque Français d'Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédicale , Mar 2024, Grenoble, France
- article
- 🏆 This poster was awarded with the Best poster in medical imaging price during the conference, sponsored by Guerbet.
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2023
Journal papers
- titre
- On the benefits of self-taught learning for brain decoding
- auteur
- Elodie Germani, Elisa Fromont, Camille Maumet
- article
- GigaScience, 2023, 12, pp.1-17. ⟨10.1093/gigascience/giad029⟩
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Poster communications
- titre
- Exploring variability patterns in the task-fMRI analytical space
- auteur
- Elodie Germani, Elisa Fromont, Camille Maumet
- article
- OHBM 2023 - 29th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jul 2023, Montreal, Canada
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- titre
- Representation learning for more reproducible fMRI data analyses
- auteur
- Elodie Germani, Elisa Fromont, Camille Maumet
- article
- IABM 2023 - Colloque Français d'Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédical, Mar 2023, Paris, France. pp.1
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2022
Poster communications
- titre
- FMRI data analysis: How does analytical variability vary with sample size?
- auteur
- Elodie Germani, Camille Maumet
- article
- OHBM 2022 - 28th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2022, Glasgow, United Kingdom. pp.1-5
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2020
Journal papers
- titre
- SAPHIR: a Shiny application to analyze tissue section images
- auteur
- Elodie Germani, Hugues Lelouard, Mathieu Fallet
- article
- F1000Research, 2020, 9, pp.1276. ⟨10.12688/f1000research.27062.2⟩
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